Фамилия Махамханова — женская форма фамилии Махамханов, и её происхождение напрямую связано с тюрко-исламским именем Махамхан. Это имя представляет собой стяжение, сращение двух арабских имён — Махаммад (Мухаммад) и Хан. Первое, Махаммад, означает «восхваляемый» и является именем пророка ислама; второе, Хан, изначально тюркский титул «правитель, владыка». Таким образом, имя Махамхан можно перевести как «прославленный правитель» или «хан Мухаммад», что было популярным составным именем у народов, принявших ислам, особенно среди татар, башкир, казахов и народов Кавказа.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для русского языка: к основе имени Махамхан добавляется русский патронимический суффикс -ов (в женской форме -ова). Такой способ образования фамилий был характерен для дворянства и духовенства, но особенно широко распространился среди крестьянства и городских сословий в XIX веке после отмены крепостного права, когда массово фиксировались фамилии по отцу. В данном случае предок, носивший имя Махамхан, дал начало роду Махамхановых.

Географически фамилия Махамханова не является широко распространённой, что указывает на её локальный характер. Вероятнее всего, она встречается в регионах России с традиционно мусульманским населением: в Татарстане, Башкортостане, а также в республиках Северного Кавказа (например, в Дагестане, Чечне, Ингушетии), где составные имена из арабских корней и тюркских титулов были обычной практикой. В этих местах фамилия могла возникнуть независимо в нескольких родах, не связанных кровным родством, но объединённых общей ономастической традицией.

Стоит отметить, что в отличие от фамилий, образованных от профессий (Кузнецов) или внешних признаков (Беляев), фамилия Махамханова — «имяческая». Она не рассказывает о ремесле или характере предка, но прямо указывает на его имя, которое, в свою очередь, несло в себе пожелание власти и благочестия. В дореволюционной России носители такой фамилии, скорее всего, относились к сословию государственных крестьян или мещан, а не к крепостным, так как мусульманское население окраин империи реже попадало в крепостную зависимость.