Фамилия Махмадходжаев — одна из тех, что пришли в русский обиход из Средней Азии, а точнее — из таджикского или узбекского языков. Её основа — составное личное имя Махмадходжа, которое, в свою очередь, складывается из двух частей. Первая, «Махмад», — это местная форма имени Мухаммад (пророк ислама). Вторая, «ходжа», — почётный титул, восходящий к персидскому «хваджа» (господин, хозяин, наставник). В исламской среде ходжами называли потомков пророка или просто уважаемых, грамотных людей, часто купцов или духовных лиц. Таким образом, имя Махмадходжа означало «господин Мухаммад» или «Мухаммад-наставник».

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединили к таджикской основе. В русском языке суффикс -ев обычно указывает на принадлежность («чей?»), поэтому Махмадходжаев буквально — «сын Махмадходжи». Такая модель характерна для многих фамилий народов Средней Азии, которые попали в паспортную систему в XIX–XX веках: русская администрация русифицировала местные имена и прозвища, добавляя фамильные окончания.

Географически фамилия чаще всего встречается в Таджикистане и среди таджикской диаспоры, а также в Узбекистане, где титул «ходжа» был особенно распространён. В России её носители — в основном потомки выходцев из этих регионов. Социальный контекст ясен: предок носителя был не просто человеком по имени Махмад, а человеком с положением — либо духовным авторитетом, либо зажиточным ремесленником или торговцем, которого окружающие величали «ходжа».

Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий, где суффикс указывает на отчество (Иванов — сын Ивана), здесь он присоединён к полному составному имени, а не к сокращённой форме. Это говорит о том, что фамилия закрепилась сравнительно поздно, когда имя уже воспринималось как единое целое, а не разбиралось на части. Однокоренные фамилии — Махмадов, Махмадкулов, Ходжаев — показывают, что в основе могли лежать те же компоненты, но в разных сочетаниях. Махмадходжаев же выделяется именно сращением двух значимых элементов, что делает её более редкой и «говорящей» о статусе предка.