Фамилия Махсотова — довольно редкая и при этом прозрачная по происхождению. В её основе лежит мужское имя Махсот, которое представляет собой вариант арабского имени Махсуд (Максуд). В переводе с арабского оно означает «желанный», «долгожданный», «цель», «стремление». Такое имя часто давали долгожданному, вымоленному ребёнку, что делает фамилию «говорящей»: предок был желанным сыном.

Главная особенность словообразования — суффикс -ов, который указывает на русскую модель патронимической фамилии («чей?» — сын Махсота). Однако сама основа Махсот — это не исконно русское, а тюркское или татарское имя, распространённое у народов, исповедующих ислам. Фонетический переход «с» в «с» (Максуд → Махсот) характерен для некоторых тюркских диалектов, где звук «к» перед гласными может озвончаться или переходить в «х». Таким образом, фамилия Махсотова — яркий пример того, как арабское имя, пройдя через тюркскую языковую среду, оформилось по русской грамматической модели.

Территориально фамилия тяготеет к регионам Поволжья и Урала, где исторически смешивались русское и татаро-башкирское население. Встречается она и у татар, и у русских, чьи предки приняли православие, но сохранили имя в качестве основы для фамилии. Морфологически фамилия стоит в женском роде (Махсотова), а мужской вариант — Махсотов.

В отличие от более частых фамилий на -ин (вроде Махсотин), форма на -ов здесь неслучайна: она говорит о том, что прозвище или неканоническое имя Махсот было зафиксировано в документах именно в такой форме, без дополнительных суффиксов. Если бы предка звали Махсотка (с уменьшительным суффиксом), фамилия звучала бы как Махсоткин. Выбор -ов — признак того, что имя воспринималось как полное, а не как домашнее.