Фамилия Малчасян — армянская по происхождению, что видно по характерному суффиксу -ян. В армянской ономастике этот патронимический суффикс заменял древние окончания -янц, -енц и указывал на принадлежность к роду: Малчасян буквально значит «из рода Малчаса» или «потомок Малчаса». Основа фамилии — личное имя или прозвище Малчас, которое само по себе составное.

Первая часть — «мал» — восходит к армянскому слову «мал» (մալ), что означает «овца» или «баран». Вторая часть — «час» (часто встречается в армянских именах как суффикс или корень со значением «волос», «шерсть» или «прядь»). Таким образом, Малчас — это, скорее всего, прозвище, данное человеку за густую, курчавую шерстистую шевелюру, напоминавшую овечью шерсть. В армянской традиции такие прозвища, основанные на внешности, были распространены и легко закреплялись за родом.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с топонимом. В Армении есть несколько сел с корнем «Мал» (например, Малхас, Малчашен), и фамилия могла образоваться от названия населённого пункта, где жил основатель рода. Однако прозвищная версия выглядит правдоподобнее: в армянских фамилиях на -ян редко встречаются прямые топонимические основы без дополнительного суффикса принадлежности.

Суффикс -ян в фамилии Малчасян — классический для Восточной Армении (территория современной Республики Армения и Нагорного Карабаха). Носители фамилии, вероятно, происходят из исторических областей Сюник, Арарат или Гехаркуник, где такие патронимы были нормой. В Западной Армении (ныне территория Турции) ту же фамилию могли бы записать как Малчас-оглы или Малчасянц.

Социальный состав предков-Малчасянов, скорее всего, был крестьянским или ремесленным: прозвище «Малчас» не указывает на знатное происхождение или духовный сан. В армянской среде фамилии на -ян массово закрепились в XIX веке, когда Российская империя ввела обязательные метрические записи, и многие армяне, ранее обходившиеся без фамилий, получили их по отцу или деду. Так что фамилия Малчасян — относительно поздняя фиксация древнего родового прозвища, которое могло существовать в устной традиции несколько столетий.