Фамилия Малинаускас — это не что иное, как балтийская «перелицовка» широко известной польской фамилии Малиновски. Если присмотреться, то ключевое изменение произошло с суффиксом: славянское -овски под влиянием литовской (или, реже, латышской) фонетики превратилось в -аускас. Это типичный пример литуанизации фамилии, когда переселенец или его потомки адаптировали польское окончание к привычному для литовского уха звучанию.

В основе фамилии лежит прозвище или именование Малиновски, которое, скорее всего, имело «географический» корень. Так называли выходца из одного из населенных пунктов с корнем «малин»: Малинов, Малиново или Малиновка. Таких топонимов немало в Польше и на территории бывшей Речи Посполитой. Названия этих мест, в свою очередь, произошли от нарицательного «малина» — либо по обилию ягод в округе, либо от прозвища первопоселенца.

Впрочем, возможен и другой путь образования: не от названия деревни, а напрямую от личного имени Малина. В старопольской и литовской традиции имя Малина (или прозвище Малина) могло даваться человеку с румяным лицом или сладким характером — по аналогии с ягодой. В таком случае фамилия Малинаускас — это «сын Малины» или «потомок Малины».

В документах начала XX века фамилия встречается в Литве: например, Малинаускас Антон Адамович (1911 г.р., с. Мильжаны), Малинаускас Ионас сын Юргиса (1898 г.р.) и Стасис Антано. Эти записи подтверждают, что к тому времени фамилия прочно укоренилась в литовской среде, сохранив связь с польским оригиналом, но обретя местное, балтийское окончание.