Фамилия Малипко — яркий пример украинской модели образования фамилий с помощью суффикса -ко. В украинской ономастике этот суффикс — едва ли не самый распространённый способ создания фамилий от прозвищ, имён или названий занятий. Он выполнял роль уменьшительности или принадлежности, а со временем закрепился как фамильный показатель, особенно на Левобережье и в центральных областях Украины.

Основа фамилии — Малип. Здесь мы сталкиваемся с редким и неочевидным корнем. Самая вероятная версия: в основе лежит прозвище Малипа, образованное от двух слов: «малий» (маленький) и «липа» (дерево). Прозвище могло указывать на невысокого человека или на того, кто жил у небольшой липы. В украинских говорах слово «липа» имело и переносное значение — «простак», «недалёкий человек», поэтому прозвище могло носить ироничный оттенок. Менее убедительна версия о связи с тюркским «малип» (господин, хозяин) — она не подкреплена географией фамилии.

Словообразовательная цепочка выглядит так: прозвище Малипа → Малипко (буквально «маленький Малипа» или «сын Малипы»). Со временем именование по отцу застыло в форме фамилии, которая передавалась по наследству. Аналогичные примеры — Дерипаско, Коваленко, Бойко.

Географически фамилия Малипко тяготеет к Полтавщине, Черкащине и Киевщине — регионам, где суффикс -ко исторически был особенно активен. Встречается она и в современных украинских диаспорах, но частотность остаётся невысокой. В дореволюционных переписях носители фамилии фиксировались в основном среди крестьян и казаков, что типично для фамилий на -ко, не связанных с дворянскими родами.

В написании фамилии возможны варианты: Малипко, Малипка (как женская форма в разговорной традиции), а также Маліпко (с украинской «і»). В русскоязычных документах фамилию часто записывали на слух, поэтому можно встретить редкое написание Малибко, если прозвищная основа была переосмыслена как «малый бік» (малый бок), но это уже вторичная народная этимология.