Фамилия Малоховский звучит как типичная польская или белорусская фамилия на -ский, но её основа может ввести в заблуждение. Вопреки первому впечатлению, она не связана напрямую с прилагательным «малый» или словом «мало». Скорее всего, перед нами топонимическая фамилия, образованная от названия населённого пункта вроде Малохово, Малохов или Малоховка. Такие названия встречаются в Польше, Беларуси и на западе России. Человек, получивший фамилию Малоховский, вероятно, был выходцем из такого места — либо владел им, либо просто жил там.

Корень «Мал-» здесь мог быть не славянским, а балтским или древнепрусским. В литовском языке есть слово malka — «дрова», а в прусском malunis — «мельница». Если исходное название поселения звучало как «Малохово», оно могло означать «место, где рубят лес» или «посёлок у мельницы». Со временем славянское население переосмыслило непонятный корень, приблизив его к знакомому «мало». Это частая история: фамилия живёт веками, а её первоначальный смысл стирается.

Суффикс -овский типичен для шляхетских фамилий Речи Посполитой. В XVI–XVII веках польская знать активно брала фамилии по названиям своих имений, прибавляя окончание -ский/-цкий. Малоховские могли быть мелкопоместной шляхтой, владевшей хутором или деревней, либо их предки получили фамилию при переходе в православие, когда священники давали «благородное» окончание крестьянам. Второй вариант вероятнее, если фамилия встречается в восточных регионах — на Смоленщине, в Брянской области или на Украине.

Встречается и редкий вариант написания — через «а»: Малаховский. Это не опечатка, а диалектное произношение: в некоторых говорах «о» в безударном положении переходило в «а». Однако исходная форма всё же с «о», иначе фамилия сливалась бы с более распространённой Малаховской (от имени Малахия или Малафей). Малоховские — отдельная ветвь, и их родословную стоит искать в польских метриках или в документах Гродненской и Витебской губерний.