Фамилия Малошкова образована по редкой для русских фамилий модели — с суффиксом -ов- от прозвища, оканчивающегося на -ко. Такая словообразовательная цепочка (Малошко → Малошков) характерна в основном для украинской и белорусской ономастики, где уменьшительные формы на -ко особенно распространены. В русской традиции фамилии на -ков обычно возникали от имён и прозвищ на -к, но здесь исходная форма — именно Малошко, что сразу указывает на западнорусское или малороссийское происхождение корня.

Основа фамилии — корень «мал-», связанный с прилагательным «малый». Прозвище Малошко могло означать невысокого человека, младшего в семье или того, кто казался окружающим «маленьким» по статусу или возрасту. Уменьшительный суффиск -ошк- придаёт слову ласкательный или бытовой оттенок: так могли называть подростка, паренька невысокого роста, а в некоторых говорах — и просто младшего сына, «малыша» в семье. Встречаются и параллельные формы вроде Малюшко, Малешко — они того же корня, но с другими суффиксами.

Стоит отметить, что фамилия Малошков (а женская форма Малошкова — это вариант жены или дочери Малошкова) не упоминается в классических дореволюционных справочниках дворянских родов. Это указывает на её крестьянское или мещанское происхождение: предки носителя фамилии, скорее всего, были людьми податных сословий — крестьянами или ремесленниками. Географически фамилия тяготеет к юго-западу России, а также к Беларуси и Украине, где суффиксальные прозвища на -ко были повседневной нормой.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Малов, Малютин, Малых, — то Малошкова выделяется именно редкой уменьшительной формой. Это не просто «малый», а «маленький свой», почти домашнее прозвище, которое закрепилось в документах. В современных телефонных справочниках и базах данных фамилия встречается нечасто, что подтверждает её локальный характер: вероятно, она возникла в одном или нескольких соседних сёлах и не получила широкого распространения по стране.