Фамилия Малюнова — женская форма, мужской вариант — Малюнов. В основе лежит личное имя или прозвище Малюн. Чаще всего его связывают с прилагательным «малый», то есть невысокий ростом, младший в семье или просто незначительный по положению. В русских говорах слово «малюн» могло означать «малыш», «коротышка» — так могли прозвать ребенка или невысокого взрослого.

Суффикс -ов указывает на типичную модель образования русских фамилий: от прозвища отца (чей сын? — Малюнов). Это значит, что первый носитель фамилии, скорее всего, был сыном человека по прозвищу Малюн. В XV–XVII веках такие прозвища были распространены повсеместно, и фамилия не привязана к какой-то одной местности — её можно встретить и в центральных областях России, и на севере, и в Поволжье.

Интересно, что у фамилии есть редкая параллель — Малюнков, где суффикс -к- уменьшительно-ласкательный. Но Малюнов проще и древнее: без дополнительного уменьшительного суффикса, напрямую от прозвища. Встречается также вариант Малюнин (с суффиксом -ин), но он менее типичен для русской ономастики и мог возникнуть под влиянием местных говоров.

Версия о происхождении от украинского или белорусского «малюнок» (рисунок) маловероятна: слово «малюнок» вошло в обиход позже, чем сформировались фамилии, и не дало прозвищ. Поэтому основная и самая правдоподобная гипотеза — от «малый» с суффиксом -ун, который в древнерусском языке часто образовывал прозвища по характерному признаку (ср. «горбун», «шептун»). Так что предки носителей фамилии Малюновы, скорее всего, были людьми невысокого роста или младшими в роду.