Фамилия Малзубова — женская форма фамилии Малзубов, и её редкость сразу бросается в глаза. В русском языке эта фамилия не встречается в списках распространённых, и её происхождение, скорее всего, связано с неславянскими корнями. Если отбросить типичный русский патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Малзубов), то основа «Малзуб» звучит нехарактерно для исконно русских прозвищ. В ней нет очевидных славянских корней, таких как «мал-» (маленький) или «зуб-» (зуб), которые могли бы сложиться в прозвище вроде «Малозуб» (человек с мелкими или редкими зубами). Однако написание через «лз» (Малзуб, а не Малозуб) указывает на иное происхождение.

Скорее всего, фамилия Малзубова имеет тюркские или кавказские корни. В тюркских языках компонент «мал» часто означает «скот», «имущество» (от арабского «маль» — богатство), а «зуб» может быть искажённым вариантом личного имени или прозвища. Например, в осетинском или кумыкском языках встречаются фамилии, образованные от прозвищ, связанных с хозяйством или родом занятий. Возможна и версия, что «Малзуб» — это адаптированное к русской грамматике арабское имя (например, Малик Зубайр или что-то подобное), которое при записи в метрических книгах упростили до Малзуба. В пользу неславянского происхождения говорит и то, что в русских говорах сочетание «лз» встречается редко, чаще в заимствованных словах.

Географически фамилия Малзубова может быть привязана к регионам, где происходила активная русификация местных фамилий: Северный Кавказ, Поволжье (татары, башкиры) или южные губернии России. В дореволюционных списках и советских базах данных фамилия встречается единично, что подтверждает её локальный характер. Носители могли быть из числа крещёных горцев или татар, получивших фамилию по имени предка-основателя. Если же отбросить тюркскую версию, остаётся редкий вариант: прозвище «Малзуб» могло возникнуть в какой-нибудь артели или профессиональной среде как искажение другого слова (например, «малозуб» в диалектном произношении), но это менее вероятно из-за устойчивости написания.

Таким образом, фамилия Малзубова — это почти наверняка русифицированная форма восточной фамилии, которую предок-мужчина получил по имени или прозвищу, а затем передал потомкам. Точное значение исходного слова сегодня установить сложно, но ясно, что за ней стоит не русское бытовое прозвище, а история межэтнических контактов.