Фамилия Мамедрагимов — яркий пример азербайджанской или тюркской модели образования фамилий, которая в процессе русификации получила стандартный русский суффикс -ов. Её основа — составное мусульманское имя Мамедрагим. Оно, в свою очередь, сложено из двух частей: «Мамед» — это тюркская и кавказская форма имени Мухаммад (пророк ислама), а «Рагим» — арабское имя, означающее «милостивый», «милосердный» (один из эпитетов Аллаха — Ар-Рахим). Таким образом, имя Мамедрагим можно перевести как «Мухаммад Милостивый» или «прославляющий милосердие пророка».

В отличие от русских фамилий, которые часто образовывались от прозвищ или профессий, подавляющее большинство фамилий у азербайджанцев и народов Кавказа возникло из отчеств. Мамедрагимов буквально означает «сын Мамедрагима». Суффикс -ов (женская форма -ова) был добавлен в XIX–XX веках, когда Российская империя, а затем и СССР, ввели обязательные метрические записи и требовали «обрусить» фамилии, добавив к тюркской основе типичное русское окончание.

Географически фамилия Мамедрагимов тяготеет к Азербайджану, а также к регионам России с компактным проживанием азербайджанцев и лезгин — в первую очередь к Дагестану. Встречается она и в других республиках Закавказья. Интересно, что в среде лезгин или талышей имя «Мамед» могло писаться чуть иначе, но в русской записи оно закрепилось именно в таком виде.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на последний слог — Мамедраги́мов, хотя в бытовой речи в русскоязычной среде его иногда смещают на третий слог (Мамедра́гимов). Второй вариант ближе к произношению исходного имени, где ударным был второй слог: Мамедраги́м. Поскольку фамилия редкая и не имеет массовой «раскрученной» истории, её обладатели могут смело связывать своё происхождение с родом, в котором чтили исламские имена и традиции имянаречения.