Фамилия Манэли — редкая, не входит в привычные русские модели на -ов, -ин или -ский. Её окончание -и сразу указывает на иноязычное происхождение, и здесь возможны две основные версии, обе связанные с Кавказом.

Первая и наиболее вероятная версия — грузинская. В грузинском языке фамилии с окончанием -и (Манэли, Гулиэли, Цители) указывают на происхождение из определённого места. Корень «ман-» в грузинской топонимике встречается: например, село Манави в Кахетии. Суффикс -эли (или -ели) означает «тот, кто из»: Манэли — «выходец из Манави» или из другой местности с основой «ман-». Такие фамилии типичны для восточной Грузии, особенно Кахетии и Картли.

Вторая версия связывает фамилию с осетинским языком. В осетинском есть слово «мæнæ» (вот, здесь) или личное имя Манэ, которое могло стать прозвищем. Окончание -и в осетинских фамилиях тоже распространено (Джиоев в осетинском звучит как Джиои, но в русской передаче часто добавляют -ев). Однако форма Манэли больше напоминает грузинскую словообразовательную модель.

Обратите внимание на написание: в русском языке фамилия склоняется по правилам существительных мужского рода на -и (Манэли, Манэли, Манэли), а женский вариант остаётся неизменяемым. Исторически носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками из грузинских горных селений — фамилии такого типа редко встречаются у дворянства, которое чаще носило фамилии на -швили или -дзе.

Среди известных носителей фамилия не зафиксирована в крупных энциклопедиях, что подтверждает её локальный характер. Если ваши предки носили эту фамилию, ищите корни в восточной Грузии или среди осетин, живших в Грузии.