Фамилия Мангирова, скорее всего, женская форма от фамилии Мангиров. Её основа — прозвище или нецерковное имя Мангир. В русской ономастике это слово не имеет однозначного славянского корня, поэтому искать происхождение стоит в тюркских языках. В ряде тюркских наречий «мангир» или «манкыр» означает «глухой» или «не слышащий». В переносном смысле так могли назвать человека с плохим слухом или, что вероятнее, того, кто не отзывался на зов, упрямого, «глухого к просьбам». Это типичная модель для прозвищ по физическому недостатку или особенности характера.

Суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилий от иноязычной основы. Однако сама фамилия Мангирова редка и имеет отчетливую географическую привязку. В основном она встречается в регионах Поволжья и Приуралья, где исторически проживают татары, башкиры и другие тюркоязычные народы. Это наводит на мысль, что фамилия могла возникнуть в среде крещёных татар или башкир, которые перенимали русскую фамильную модель, сохранив тюркское прозвище.

Существует и альтернативная версия, менее распространённая, но лингвистически возможная. В некоторых диалектах «мангир» могло обозначать разновидность растения или травы. В таком случае прозвище дали бы травнику, знахарю или человеку, собиравшему лекарственные сборы. Но эта гипотеза слабее: у неё нет устойчивой лексической опоры в тюркских языках, тогда как значение «глухой» встречается последовательно.

Фамилия Мангирова не принадлежала дворянским родам — её нет в родословных книгах Российской империи. Скорее всего, предки носителей этой фамилии были государственными крестьянами или ясачными людьми (нерусскими жителями, платившими подать пушниной или деньгами). Судя по ареалу, они могли заниматься земледелием, скотоводством или бортничеством в южных уральских степях.