Фамилия Манивалиев — редкий пример, где основа не славянская, а тюркская, а суффикс — русский, что сразу указывает на позднее оформление фамилии в среде, перешедшей на русский язык. Если разложить её на части, то корень «Манивал» притягивает к себе вопрос: от какого слова он произошёл?

Самая вероятная версия — от арабского имени Манивал (или Маниуал), которое в тюркских языках, особенно у народов Поволжья и Средней Азии, могло означать «желанный», «долгожданный» или «тот, кого ждали». Встречаются варианты этого имени у татар, башкир, узбеков. Вторая, менее распространённая гипотеза — связь с прозвищем от тюркского «мани» (что-то вроде «маленький», «крошка») с добавлением аффикса, но она слабее, так как суффикс «-вал» нехарактерен для тюркских прозвищ.

Русский суффикс «-ев» (вместо ожидаемого «-ов» из-за мягкого «л») говорит о том, что фамилию дали уже в русскоязычной среде: скорее всего, при переписи или в документах XIX — начала XX века. Носители фамилии — потомки крещёных или обрусевших татар, башкир или представителей других тюркских народов, которые жили в смешанных регионах, например, в Оренбургской, Уфимской или Казанской губерниях.

По сословному происхождению точных данных нет, но, судя по модели (имя + русский суффикс), это фамилия недворянская — скорее крестьянская или мещанская. Уникальность Манивалиева в том, что его почти не встретишь за пределами бывшей Российской империи: это локальный антропоним, который сформировался на стыке культур и сохранил память о мусульманском имени, адаптированном под православную метрику.