Фамилия Маноцкова — женская форма, а её мужской вариант Маноцков. В основе фамилии лежит не личное имя и не прозвище по профессии, а географическое название. Исходным пунктом стал топоним Маноцкий — хутор в Тарасовском районе Ростовской области. Такой тип фамилий характерен для южнорусских регионов, где активно использовались прозвища, указывающие на место прежнего жительства.

Название хутора Маноцкий, в свою очередь, связано с гидронимом Маныч. Это речная система на юге России, известная ещё с древних времён. Переход «Маныч — Маноцкий» — результат адаптации тюркского названия через русскую словообразовательную модель: суффикс -ск- и типичное для топонимов окончание -ий. Форма Маноцков образована по той же схеме, что и фамилии вроде Воронежский — Воронежсков: от названия местности на -ский отсекли окончание и добавили фамильный суффикс -ов. То есть первоначально Маноцков означало «человек из Маноцкого».

По сути, Маноцкова — это фамилия-маркер переселения. Предок носителя фамилии, скорее всего, покинул хутор Маноцкий и обосновался в другом месте, где его и прозвали по прежнему адресу. Этот механизм — называть пришлого человека по месту, откуда он явился, — один из самых распространённых в русской ономастике. Других версий происхождения фамилии, например от календарного имени или ремесла, не прослеживается: основа слишком явно привязана к конкретному топониму на Дону.