Фамилия Мантушкина — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Мантушкин. Её ядро — прозвище или нецерковное имя Мантушка. Мантушка — это уменьшительно-ласкательная форма от имени Мантуй, Мантут или Мантуля. А те, в свою очередь, образованы от крестильного имени Мануил (от древнееврейского «с нами Бог») через народное переосмысление: Мануйло, Мануй, Мантуй. Такой путь — от полного имени к цепочке уменьшительных форм — типичен для русских фамилий, особенно в среде крестьян и посадских людей, где официальное имя в быту заменяли домашними вариантами.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мантушкин буквально означает «сын Мантушки». Это одна из самых распространённых моделей русских фамилий (наряду с -ов/-ев). Интересно, что основа Мантушка могла быть не только производной от Мануила, но и самостоятельным прозвищем: в северных и сибирских говорах «мантулить» значило «медленно, лениво работать», а «мантус» — нерасторопный человек. В таком случае фамилия отражала бы не имя, а характер предка. Однако версия с каноническим именем Мануил выглядит убедительнее: подобные редуцированные формы (Мантуй, Мантуха) фиксируются в исторических документах XV–XVII веков, например, в новгородских писцовых книгах.

Географически фамилия Мантушкин (и Мантушкина) тяготеет к центральным и северным областям России. Она встречается в Тверской, Ярославской, Вологодской губерниях, а также на Урале, куда переселенцы принесли её в XVIII–XIX веках. В некоторых регионах фамилию могли записать через «о» — Монтушкин, что связано с акающим произношением. Сословно это, скорее всего, крестьянская или мещанская фамилия: дворянские роды с таким окончанием редки, и в «Общем гербовнике» Мантушкины не значатся.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Мантуров, Мануйлов, Манухин) показывает, что Мантушкин — одна из самых компактных и ласкательных форм. Если Мануйлов прямо отсылает к полному имени, то Мантушкин — к уменьшительному, что говорит о более тесной, семейной основе прозвища. Человек по прозвищу Мантушка, вероятно, был младшим в семье или же его так называли в детстве, и имя закрепилось за ним на всю жизнь, а затем перешло к детям как фамилия.