Фамилия Маняткина — женская форма; её мужской вариант — Маняткин. В центре внимания здесь не столько корень, сколько редкий суффикс -атк-, который сразу выдает способ образования: от прозвища или имени, оканчивающегося на -ята.

Разбираем основу. В древнерусском языке суффикс -ят(а) (а позже -ат(а)) образовывал названия детёнышей животных (телята, поросята) и, что важнее для фамилий, уменьшительно-ласкательные формы личных имён. Например, от имени Мануил (греческое «Бог с нами») в народной речи легко получалось Маня, а от него — Манятка (маленький Маня). Суффикс -к- добавлял дополнительный оттенок уменьшительности. Так что Манятка — это, скорее всего, ласковое прозвище ребёнка или младшего в семье, которого звали Маней.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая: прозвище Манятка могли дать взрослому человеку по какой-то внешней или поведенческой черте. Глагол «манить» (звать, привлекать) мог породить прозвище Манило или Манята для того, кто заманивал, привлекал внимание. Однако в таком случае фамилия скорее звучала бы как Манилкин или Манилов (сравните с гоголевским Маниловым). Форма на -ятка всё-таки тянет к детскому, семейному прозвищу.

Фамилия Маняткина не относится к числу распространённых. Она встречается в Поволжье и некоторых центральных областях России, но редка. По сословной принадлежности, скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где были живы традиции внутрисемейных прозвищ. Дворянских родов с такой фамилией в истории не зафиксировано.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Маняткин стоит в одном ряду с Манюковым, Манюшкиным, Маньковым — все они восходят к разговорным формам имени Мануил или к его варианту Мануйло. Но суффикс -атк- выделяет Маняткина как фамилию, образованную не от полного имени, а от его самой ласковой, «детской» формы.