Фамилия Манызов — один из тех случаев, когда корень слова не лежит на поверхности и требует небольшого исторического расследования. В основе фамилии лежит прозвище или мирское имя Маныз, которое в русских говорах имело конкретное, хоть и нелестное значение. В словарях диалектов (например, владимирских, ярославских) «маныз» — это плакса, нытик, капризный человек. В других областях слово могло означать «обманщик», «плут» (от глагола «манить» — обманывать, завлекать). Таким образом, первый носитель фамилии получил её, скорее всего, за особенность характера: либо был обидчивым и слезливым, либо, наоборот, хитрым и изворотливым.

Словообразовательная модель здесь проста и показательна: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — Манызов). Это типичная русская фамилия, образованная от прозвища, а не от крестильного имени. В отличие от фамилий на -ин (от основ на -а/-я), форма на -ов говорит о том, что исходное прозвище заканчивалось на твёрдый согласный: Маныз → Манызов.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России. В переписях XVII–XVIII веков прозвище Маныз встречается среди крестьян и посадских людей. Фамилия редкая, не «дворянская» и не «купеческая» — её носители почти наверняка были из крестьянской или мещанской среды. В дореволюционных источниках она могла писаться через «ы» (Манызов) или «и» (Манизов) — второй вариант встречается чаще, но он же сбивает с толку, так как похож на фамилии от имени Мануил (Манилов).

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: от тюркского слова «маныз» (след, знак, пятно). Но она слаба, потому что фамилия не имеет типичных тюркских суффиксов (вроде -ов не в счёт, он уже русский), а диалектное русское значение «плакса» документировано лучше. Так что, скорее всего, предок современного Манызова был человеком с неспокойным нравом — либо его дразнили за слёзы, либо за склонность к хитростям.