Фамилия Мардяхина — женская форма фамилии Мардяхин, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем или прозвищем Мардяха. Сама основа фамилии — «Мардях» — звучит необычно для русского уха, что сразу наводит на мысль о заимствовании. Скорее всего, это тюркское или арабское имя. В тюркских языках есть основа «мард» — «мужчина», «мужественный», восходящая к арабскому слову «мард» (муж, человек). Уменьшительно-ласкательная форма с суффиксом «-ях» (Мард-ях) дала прозвище Мардяха, которое и стало основой фамилии.

Суффикс «-ин» в фамилии Мардяхин — классический русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: «чей?» — Мардяхин, то есть «сын Мардяхи». Такая модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков, когда в ходу были прозвища на «-а/-я»: Кузя — Кузьмин, Петря — Петрин, Мардяха — Мардяхин. Интересно, что ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — МардЯхина, что тоже характерно для фамилий от подобных основ.

Географически фамилия Мардяхины встречается в основном в центральных и южных регионах России, а также в Поволжье. Это неудивительно: в этих местах исторически было сильное татарское и башкирское влияние, и тюркские имена легко входили в русский быт. Предок Мардяхиных мог быть крещёным татарином, башкиром или чувашом, принявшим православие, — тогда его личное имя Мардяха (или Мардях) записали в церковной книге, и оно закрепилось за родом. Впрочем, не исключён и чисто прозвищный вариант: на Руси «мардякой» могли в шутку назвать рослого, крепкого мужчину, «настоящего мужика», и это прозвище тоже дало фамилию.

Других версий, например, от славянского корня «мард-» (которого в славянских языках нет), или от географического названия, не существует — фамилия явно не русская по корню. Таким образом, Мардяхина — это фамилия с тюркскими корнями, образованная по русской модели, и в основе её лежит понятие мужественности и силы.