Фамилия Маринухин — одна из тех русских фамилий, в которых хорошо видна живая словообразовательная игра. Её основа — мужское крестильное имя Марина, которое в православной традиции давали женщинам (в честь святой Марины, она же великомученица Маргарита). Однако в русском языке от женских имён фамилии образуются редко. Здесь сработала народная логика: имя Марина могло принадлежать матери, а сына в быту называли Маринуха — «сын Марины». Суффикс -ух(а) в русских прозвищах и полуименах был распространён в XVI–XVII веках (сравните: Петруха, Митюха, Ванюха). Он придавал фамильярный, часто ласкательный оттенок. От формы Маринуха с помощью стандартного патронимического суффикса -ин и возник Маринухин — буквально «чей?» — «сын Маринухи».

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным областям. Встречается в Воронежской, Рязанской, Тамбовской губерниях, а также на Кубани. Это косвенно подтверждает, что фамилия крестьянская или мещанская: в дворянской среде такие «усечённые» формы с суффиксом -ух(а) почти не употреблялись. Если ваш предок носил фамилию Маринухин, он, скорее всего, был выходцем из крестьянской семьи, где мать звали Мариной, а сына в обиходе выделяли по материнскому имени.

Важный нюанс: фамилия Маринухин не имеет отношения к мужскому имени Марин (оно существует, но крайне редкое). Искать корень в слове «марина» как «морская» тоже не стоит — это калька с латыни, которая пришла в русский язык позже и не использовалась в народной среде для прозвищ. Таким образом, фамилия чисто матронимическая, что само по себе редкость для русского ономастикона: обычно фамилии образовывали от имени отца. Маринухин — один из тех случаев, когда женщина, вдова или сильная хозяйка, оставила след в родовом имени.

Сравните с однокоренными: Маринин (от имени матери напрямую), Маринов (от мужского имени Марин или от фамилии на -ов), Маринушкин. Форма Маринухин стоит особняком — она звучит более «деревенской» и архаичной, сохранившей живой суффикс, который почти исчез из современного именослова.