Фамилия Марисенков — редкий пример, где за основу взяли не отчество, а имя матери или церковное имя Марис. В переводе с латинского Марис означает «морской», и это мужское имя встречалось в святцах. Однако есть и другая версия: Мариса — вариант имени Мария, распространённый в Венгрии, Словакии, Голландии и Польше. Если фамилия метронимическая, то есть образована от женского имени, это указывает на нестандартную семейную ситуацию: женщина могла стать главой семьи из-за вдовства, болезни мужа или его долгой службы в армии (рекрутские наборы длились 25 лет). Такие фамилии встречаются редко — традиционно родословную вели по отцу.

Словообразовательная модель здесь двойная. Сначала появилась форма Марисенко — типичный украинский или белорусский патроним с суффиксом -енко, который обозначал «маленький», «сын» или «потомок». Затем, когда носители фамилии переселились в великорусские земли, её русифицировали, добавив суффикс -ов, характерный для центральной России. Так Марисенко превратился в Марисенкова — по тому же принципу, что Иващенко стал Иващенковым или Гриценко — Гриценковым.

Географически фамилия тяготеет к южным и центральным областям России, куда в XVII–XIX веках активно переселялись украинские и белорусские крестьяне. Встречается она нечасто — в современных телефонных справочниках и базах данных носителей можно пересчитать по пальцам. Это не умаляет её ценности: именно такие фамилии лучше всего сохраняют память о женской линии рода или о редком каноническом имени, которое почти вышло из обихода.