Фамилия Мартынушкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Мартынушкин послужило церковное имя Мартин. Имя Мартынушка (каноническая форма — Мартин) в переводе с латинского языка означает "посвященный Марсу; воинственный". Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мартынушка, со временем получил фамилию Мартынушкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Мартынушкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мартынушкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.