Фамилия Мартюшкин — типичный пример русской фамилии, образованной от имени через суффикс принадлежности. В её основе лежит разговорная форма крестильного имени Мартин (от латинского Martius — «посвящённый Марсу», то есть воинственный). В русской народной среде это имя приобрело множество уменьшительных и обиходных вариантов: Мартын, Мартя, Мартюша, Мартюшка. От последнего, Мартюшка, и пошла фамилия Мартюшкин. Суффикс -ин указывает на то, что перед нами «чей-то сын» или «чей-то человек», то есть Мартюшкин буквально означает «сын Мартюшки» или «принадлежащий Мартюшке».

Интересно, что имя Мартин в православных святцах встречается, но было менее распространено, чем, скажем, Иван или Пётр. Однако в народе оно прижилось благодаря святому Мартину Милостивому, епископу Турскому, которого почитали и на Руси. В результате фамилия Мартюшкин — не редкая, но и не массовая, её можно встретить в центральных регионах России, а также в Поволжье, где оседали выходцы из северных и центральных губерний.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: основа «Мартюшк-» плюс патронимический суффикс «-ин». Это отличает её, например, от фамилии Мартынов, которая образована от полной формы имени Мартын. Мартюшкин же стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Васькин, Петькин, Сашкин — то есть от сугубо домашних, неофициальных форм имени. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был, скорее всего, простым человеком, крестьянином или ремесленником, которого в быту звали уменьшительно.

В некоторых говорах «мартюшкой» могли называть и человека, родившегося в марте, что добавляет ещё один возможный, хотя и менее вероятный, вариант происхождения. Но основная версия — от имени — остаётся главной и наиболее подтверждённой ономастикой.