Фамилия Марусеченко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая означает «потомок», «сын» или «маленький». Такие фамилии в XVI–XVIII веках массово закрепились в Поднепровье, Слобожанщине и на Запорожье. Если разобрать цепочку, получается: в основе лежит имя Маруся — уменьшительная форма крестильного имени Мария (от древнееврейского «горькая», «госпожа»). Суффикс -к- дал ласкательное значение, а -енко превратило личное имя в родовое прозвище. Таким образом, первый носитель фамилии Марусеченко — это, скорее всего, сын или внук человека по имени Маруся.

Интересная особенность — редкая ступень суффиксации. Обычно от имени Маруся образуют фамилию Марусенко (через -енко напрямую). А здесь вставлен ещё один суффикс -еч- (Марус-еч-енко). Такое удвоение суффиксов типично для украинской антропонимии, особенно в западных регионах и на Полтавщине. Оно могло возникнуть, чтобы отличить одну семью от другой в одном селе: если там уже жили Марусенки, то их соседей, тоже потомков какого-нибудь Маруси, стали звать Марусеченками.

Второй, менее вероятный вариант: основа могла быть не от имени, а от прозвища Маруся, которое давали человеку с мягким, плаксивым характером (по ассоциации с «маруситься» — капризничать, дуться). Но в крестьянской и казацкой среде фамилии от канонических имён в такой форме встречаются гораздо чаще, чем от прозвищ, поэтому версия с именем остаётся основной.

По географии фамилия плотнее всего встречается в Черкасской, Кировоградской и Днепропетровской областях, что подтверждает её происхождение из центральной Украины. В русских переписях XIX века Марусеченко почти нет — это чисто украинская фамилия, и её носители, как правило, были государственными или казацкими крестьянами, реже — мещанами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.