Марыскина — фамилия, которая почти наверняка ведёт своё начало от женского имени Марыска. Это уменьшительно-ласкательная форма от Мария, Марина, Марьяна или других имён с корнем «Мар-». В русской народной традиции суффикс «-ыск-» придавал имени оттенок фамильярности или просторечия, как, например, в парах Варя — Варыска, Дуня — Дуныска, Катя — Катыска. Таким образом, Марыска — это не официальное имя, а домашнее прозвище, которое в быту закреплялось за женщиной, а потом переходило на её детей.

Модель образования фамилии прозрачна: основа Марыск- плюс типичный русский суффикс принадлежности -ин, указывающий на родство. Марыскина буквально значит «дочь (или жена) Марыски». В крестьянской среде, где фамилии часто давали по имени отца, необычен именно женский след. Обычно фамилии на -ин образовывались от мужских имён (Петров → Петровин, но чаще сразу Петров). Здесь же мы видим матриархальную модель: предок, скорее всего, был сыном женщины по прозвищу Марыска. Это указывает на то, что в семье могла быть сильная женская фигура — вдова, хозяйка или просто знахарка, чьё имя закрепилось за потомством.

Географически фамилия редкая и не имеет чёткой привязки к одному региону. Встречается разрозненно в центральных областях России и в Поволжье, что типично для прозвищных фамилий, возникших в XVII–XVIII веках. В переписных книгах и ревизских сказках Марыскины могли записываться как Марыскин, а женский вариант окончания — Марыскина — закрепился в современной орфографии, где фамилия не склоняется по родам для женщин.

Есть и менее вероятная, но возможная версия: от прозвища Марыска, данного мужчине. В русских говорах «марыскать» иногда означало «шарить, рыскать, бродить без дела». Если так, то Марыской дразнили непоседливого или любопытного человека. Однако это предположение слабее, так как суффикс -ыск- в мужских прозвищах встречается редко — обычно для мужчин использовали -ык (Марык) или -ушк (Марушка). Поэтому первая версия, с женским именем, остаётся основной.