Фамилия Масюлис — один из тех случаев, когда написание сразу выдаёт не русскую, а литовскую или польско-литовскую природу. Характерный суффикс -ис (в литовском — -is) указывает на мужской род в литовском языке и часто встречается в фамилиях жителей Литвы и исторических земель Великого княжества Литовского. Если бы фамилия была чисто русской, она звучала бы как Масюль или Масюлин, но окончание -ис прямо говорит о балтском происхождении.

Основа фамилии — Масюл- — восходит к западнославянскому или балтскому варианту имени Матвей. В литовском языке имя Матвей звучит как Motiejus, а его уменьшительные формы — Masiulis, Maselis, Masys. Масюлис — это, по сути, «сын Масюлиса» или «потомок того, кого звали Масюлис», где Масюлис — уменьшительное от Motiejus. То есть корень тот же, что и у русских фамилий Масютин, Масюков, Масленников, но с иной суффиксацией.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с литовским словом masyti — «мешать, перемешивать» или masalas — «приманка». Однако такое толкование менее вероятно, так как прозвища от глаголов действия редко давали в форме уменьшительного имени. Куда логичнее, что перед нами патроним от крестильного имени.

Географически фамилия Масюлис сосредоточена в Литве, а также в приграничных районах Беларуси и Польши (особенно в Подляшье). В России она встречается редко и почти всегда — у потомков переселенцев из западных губерний. В документах XIX века носители фамилии Масюлис чаще всего числились крестьянами или мелкими шляхтичами в Ковенской и Виленской губерниях.

Отдельного внимания заслуживает написание: в русских метрических книгах фамилию могли записывать по-разному — Масюлис, Масюлись, Масюлисъ. В польской традиции встречается вариант Masiulis, а в литовской — Masiulis (с ударением на первый слог). Современные носители фамилии в Литве пишут её через «i»: Masiulis.