Фамилия Масюженко звучит на украинский лад, и это не случайно. Суффикс -енко — один из самых узнаваемых маркеров украинской ономастики. В XVI–XVII веках он означал «маленький» или «сын»: Масюженко — буквально «маленький Масюга» или «сын Масюги». Такие фамилии закрепились в основном на Левобережной Украине, в Полтавской, Черниговской и Харьковской губерниях.

Основа фамилии — Масюга. Это уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Макарий (в быту — Макар, Макаша, Масюта). В народе имя Макар часто переделывали: усекали корень и добавляли суффиксы -юг(а), -юх(а), -юк, -юта. Так из Макара получился Масюга, а от него — Масюженко. Имя Макарий греческого происхождения и означает «блаженный», «счастливый», но в фамилии это значение стерлось — она указывает скорее на родство по отцу.

Есть и другая, менее вероятная версия. В некоторых говорах «масюга» могло быть прозвищем человека, имевшего отношение к маслу: маслобоя, торговца или того, кто любил жирно поесть. Однако для украинской модели с суффиксом -енко типично образование именно от личного имени или прозвища отца, а не от прямой профессии. Поэтому версия с именем Макар выглядит предпочтительнее.

Написание фамилии через о (Масюженко) — норма для русского и украинского языков. Встречающийся изредка вариант «Масюжэнко» — результат окающего произношения или ошибки при записи. Сравните с однокоренными фамилиями: Масюк, Масюта, Масюгин — все они восходят к тому же корню и говорят о том, что предок носителя носил имя или прозвище Масюга.

Сословно фамилия не была закреплена за какой-то одной группой. Масюженко могли быть и казаками, и крестьянами, и мещанами — суффикс -енко в XVII–XVIII веках носили все слои украинского населения, кроме шляхты.