Фамилия Маткаимов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её по частям и заглянуть в историю народов Поволжья и Урала.

Основа фамилии — имя или прозвище Маткаим. В нём слышатся два корня: «мат» и «каим». Первый, вероятнее всего, восходит к тюркскому слову «мат» (меткий, точный, или же «крепкий», «сильный»). Второй корень — «каим» — имеет арабское происхождение и означает «стоящий», «пребывающий», а в переносном смысле — «постоянный», «вечный». В составе личных имён «каим» часто указывало на устойчивость характера или долголетие. Таким образом, имя Маткаим могло означать «крепко стоящий», «непоколебимый» или «меткий и постоянный».

Фамилия образована по русской модели с патронимическим суффиксом -ов. Это стандартный способ для фамилий, возникших в среде крещёных народов Российской империи: к основе имени или прозвища отца добавляли -ов, -ев или -ин. Маткаимов — сын Маткаима. Такая словообразовательная модель говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, был крещён и жил в среде, где русский язык уже стал основным для документации.

Географически фамилия Маткаимов почти наверняка связана с башкирским или татарским населением. Сочетание тюркского и арабского корней типично для мусульманских имён, которые бытовали у башкир и татар. После принятия православия такие имена нередко закреплялись в качестве фамилий. Сравните с однокоренными фамилиями Маткаримов, Каимов, где прослеживается та же основа. Встречаемость фамилии сегодня крайне низкая, что подтверждает её локальное происхождение — возможно, от одного рода в конкретной деревне на территории современного Башкортостана или Оренбургской области.

Никаких сведений о дворянском происхождении или принадлежности к известному сословию у фамилии Маткаимов нет. Это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в XIX веке, когда у бывших государственных или удельных крестьян из нерусских народов массово оформляли фамилии по отчеству.