Фамилия Матсабуров — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а тюркская, но при этом оформлена по русской словообразовательной модели. Суффикс -ов указывает на принадлежность: буквально «чей?» — сын или потомок Матсабура. Вопрос в том, что скрывается за этим именем.

Наиболее правдоподобная версия связывает фамилию с тюркским именем Матсабур (или Матсабир). В его основе лежит арабское слово «сабур» (صَبُور) — одно из имён Аллаха, означающее «Терпеливый», «Всевыносливый». В тюркских языках, особенно у татар и башкир, такие имена с религиозным оттенком были распространены. Первая часть «мат» могла возникнуть как вариант произношения арабского «мат» (مات) — «умер», «скончался», что в составе сложного имени давало бы значение «терпение умерло» или «терпеливый до смерти». Однако это лишь реконструкция: в живой речи имена часто искажались и сокращались, так что «Матсабур» могло быть местным вариантом более известного имени.

География фамилии подсказывает её происхождение. Матсабуровы встречаются в Поволжье и на Урале — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Это регионы, где веками жили тюркские народы, а после крещения их представители нередко получали фамилии, образованные от прежних мусульманских имён. Таким образом, предок носителя фамилии был, скорее всего, татарином или башкиром, носившим имя Матсабур, а после перехода в православие его потомки стали Матсабуровыми.

Менее убедительной выглядит версия о связи с кавказскими языками. Созвучие с чеченским «матс» (язык) или грузинским «сабури» (пряность) не даёт убедительной модели образования фамилии на русский манер. Если бы фамилия была кавказского происхождения, она, скорее всего, сохранила бы местный суффикс (-швили, -дзе, -ов в чеченском) или писалась бы иначе.

Единственное, что можно сказать о социальном статусе: суффикс -ов — типичный для крестьянских и мещанских фамилий центральной России и Поволжья. Матсабуровы не принадлежали к аристократии, а были, вероятно, государственными или помещичьими крестьянами, либо служилыми людьми из «инородцев». Более точных данных о сословии нет — фамилия не фигурирует в родословных книгах дворянства.