Фамилия Матыпов — редкий пример, где прозвище, лёгшее в основу, до сих пор живёт в диалектах, но почти не встречается в литературном языке. Корень здесь — «матып» или «мотып». В русских говорах Сибири и Урала «матыпом» называли мешковатого, неуклюжего человека, а иногда — неповоротливое домашнее животное. Слово звукоподражательное: оно передаёт тяжёлую, шлёпающую походку. Прозвище Матып давали либо медлительному работнику, либо человеку крупного телосложения, который двигался с натугой.

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую модель образования фамилий: «чей?» — Матыпов, то есть сын или потомок Матыпа. Форма без уменьшительного суффикса говорит о том, что прозвище было устойчивым и не требовало смягчения — Матып, а не Матыпка или Матыпок. Встречается и вариант Матыпин, но он гораздо реже; -ов в данном случае — более поздняя и «канцелярская» модель, закрепившаяся при переписях.

Географически фамилия тяготеет к северным и сибирским регионам: Вологодчина, Архангельская область, Томская губерния. В центральных областях России она практически не фиксируется. Это косвенно подтверждает версию о диалектном происхождении: слово «матып» не вошло в общерусскую лексику, а осталось на периферии.

В ономастических справочниках фамилия не разбирается подробно — она слишком редкая. Но по аналогии с фамилиями Мотылёв, Матыгин, Матусов можно предположить, что основа не имеет отношения к тюркским или финно-угорским заимствованиям, а чисто русская, звукоизобразительная. Попытки связать её с «матерый» или «мать» лингвистически несостоятельны: ударение в исходном прозвище падает на второй слог (Маты́п), а не на первый.

Сословной привязки у фамилии нет: Матыповы могли быть и крестьянами, и мещанами. В метрических книгах XIX века носители встречаются среди государственных крестьян северных уездов. Дворянских родов с такой фамилией не известно.