Фамилия Мавотина — редкий пример, где географический акцент важнее морфологического разбора. Она почти наверняка несёт на себе отпечаток южнорусских или украинских говоров. Основа фамилии — прозвище или мирское имя Мавота. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — «Мавотин», то есть потомок человека по прозвищу Мавота. Женская форма Мавотина — это либо дочь, либо жена Мавотина.

Корень «мав-» — самый интересный элемент. В русских диалектах, особенно в курских, воронежских и донских, слово «мавый» означало «смуглый», «темнокожий», а иногда и «черномазый». «Мавота» — человек со смуглой кожей, тёмными волосами. В украинском языке «мавка» — лесная русалка, мифическое существо, но связь с прозвищем сомнительна: для фамилий чаще брали бытовые, а не сказочные черты. Правдоподобнее, что Мавотой прозвали за внешность — тёмного брюнета или цыгановатого вида человека.

Встречается и другая версия: отчество от канонического имени Маврикий. В бытовой речи его могли сокращать до Мавоты, особенно в крестьянской среде XIX века. Но имя Маврикий в России было редким, в основном монашеским, а фамилия Мавотина — не священническая, а скорее крестьянская или мещанская. Поэтому версия с прозвищем по внешности выглядит надёжнее.

Фамилия крайне редкая. В открытых базах данных и телефонных справочниках она встречается единично, преимущественно на юге России — в Ростовской области, Краснодарском крае, а также в восточных областях Украины. Это подтверждает диалектную привязку: именно в этих регионах слово «мавый» было в ходу. Носителей фамилии настолько мало, что говорить о сословной принадлежности или известных исторических фигурах не приходится — перед нами локальная, почти угасшая фамилия, сохранившая в себе народное прозвище смуглого человека.