Фамилия Мавзутов образована от арабского имени Мавзут (Мавзют), которое восходит к корню «мавзу» — «тема, предмет, сюжет». В мусульманской традиции это имя давали с пожеланием, чтобы жизнь человека была содержательной и осмысленной. Русский суффикс -ов присоединился к основе по стандартной модели, превратив имя в фамилию: Мавзут + ов = «сын Мавзута» или «потомок Мавзута». Фамилия не имеет русского или славянского корня — это типичный пример того, как тюркские народы, принявшие ислам, адаптировали арабские имена в фамильную форму.

География фамилии узкая. Мавзутовы чаще всего встречаются у татар и башкир, а также у народов Северного Кавказа, где ислам распространялся через суфийские братства. Встречается и вариант Мавзютов — с буквой «ю» вместо «у», что связано с местными диалектными произношениями. В дореволюционных метрических книгах Оренбургской и Уфимской губерний эта фамилия фиксировалась у крестьян и мещан, но не у дворян — сословный барьер для мусульманских фамилий в Российской империи был обычным делом.

С точки зрения словообразования интересна неосновная версия: некоторые исследователи выводят Мавзутов от тюркского «мавзу» — «сладкий, приятный» (сравните с узбекским «мавзу» — «вкус»). Однако арабское происхождение надёжнее, поскольку имя Мавзут встречается в исламских именословах, а тюркская параллель — скорее случайное созвучие. Фамилия редкая, не входит в сотни самых распространённых, поэтому её носители почти наверняка происходят из одного или нескольких родов, разошедшихся по разным регионам в XIX–XX веках.