Фамилия Мегенова — женская форма фамилии Мегенов, и её разговор стоит начинать с мужского варианта. Основа здесь — прозвище или неканоническое имя Меген. Скорее всего, оно связано с тюркским корнем «меген» или «мэгэн», что в ряде тюркских языков (например, в якутском, казахском, башкирском) означает «меткий», «ловкий», «искусный» или «умелый». В якутском языке слово «мэгэн» имеет значение «меткий стрелок», что прямо указывает на профессиональное прозвище охотника или воина.

Модель образования проста: к основе Меген добавили типичный русский патронимический суффикс -ов, который в женском варианте переходит в -ова. Это значит, что предок носителя фамилии Мегенов был человеком, которого в округе знали как Мегена — либо по имени, либо по прозвищу. В русской традиции XVII–XIX веков так часто фиксировали инородческие имена и прозвища, особенно на территориях с тюркским или монгольским населением: в Сибири, Поволжье, на Урале.

Географически фамилия Мегенов/Мегенова встречается редко, но её следы прослеживаются в Якутии и у татар. Это не случайно: якутское «мэгэн» даёт прямую семантическую связь. Встречаются также варианты с написанием через «э» — Мегенов, что подтверждает тюркское происхождение. В ономастических справочниках, например в работах А. Суперанской, подобные фамилии относят к группе, образованной от личных имён и прозвищ из языков народов Сибири.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на -ов, где основа — полное христианское имя (Иванов, Петров), Мегенов стоит в ряду тех, что сохранили дохристианское, языковое наследие. Это не просто «сын Мегена», а скорее «потомок того, кого называли Метким». Фамилия не получила широкого дворянского распространения и фиксировалась в основном среди крестьян и казаков, что типично для поздних патронимов из национальных окраин Российской империи.