Фамилия Мекинян — яркий представитель армянских фамилий, образованных по классической модели с суффиксом -ян (в старой орфографии -янц). Этот суффикс, восходящий к древнему -енц, означает принадлежность к роду или происхождение от предка: буквально «из рода такого-то». Если отбросить суффикс, остаётся основа Мекин — именно она и скрывает ключ к значению фамилии.

Самый вероятный источник — армянское слово «мек» (մեկ), то есть «один». В таком случае Мекин — это прозвище, которое могло означать «единственный», «одинокий» или «первый». В армянских семьях так могли называть единственного сына или ребёнка, родившегося первым. Менее распространённая, но возможная версия — связь с топонимом: в Армении есть село Меки (в Сюникской области), и фамилия могла указывать на выходца оттуда. Однако прозвищная версия выглядит убедительнее: фамилии от личных качеств встречаются чаще, чем от названий малых сёл.

Словообразовательная модель проста: Меки (основа) + н (суффикс, часто встречающийся в армянских личных именах и прозвищах, ср. Вагин, Арутюнян) + ян (родовой суффикс). То есть Мекинян — «потомок Меки» или «из рода того, кого звали Меки». Сравните с однокоренными армянскими фамилиями: Мекинян (с тем же корнем «мек»), а также Мекян, где основа та же, но без промежуточного суффикса. Различие в суффиксе могло возникнуть из-за диалектных особенностей или разного времени оформления фамилий.

В отличие от русских фамилий, армянские не несли сословной окраски: Мекинян мог быть и крестьянином, и ремесленником, и купцом. Фамилия закрепилась в основном среди армян, живших на исторической родине, а также в диаспоре. Географически чаще встречается в областях, где говорят на восточноармянском диалекте, но точных статистических данных по конкретным регионам нет. В написании на русском языке фамилия устойчива — вариантов вроде «Мекиньян» или «Мекиян» практически не бывает.