Фамилия Мендзорйте — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение напрямую связано с литовским языком. Вероятнее всего, это литовская фамилия, переоформленная по русской грамматической модели. Суффикс -ите (-ytė) в литовском языке — типичный показатель женской фамилии, образованной от отчества или прозвища мужа или отца. Мужской аналог звучал бы как Мендзорис или Мендзора. Таким образом, Мендзорйте — это «дочь» или «жена» Мендзориса.

Основа фамилии восходит к литовскому слову «mendzoras» или диалектному варианту, связанному с глаголом «mendyti» — «чинить, латать, штопать». В старых литовских говорах так могли называть портного, сапожника или вообще человека, занимавшегося починкой одежды и обуви. Фамилия, таким образом, профессиональная: предок носительницы фамилии был ремесленником, чинившим вещи.

Встречаемость фамилии крайне низкая. Скорее всего, её носители происходят из региона, исторически связанного с литовско-русским пограничьем — из бывших территорий Великого княжества Литовского (современные Литва, Беларусь, западные области России). В русской среде фамилия закрепилась в результате браков или миграции, при этом окончание -йте сохранило память о литовском происхождении, хотя по падежам такая фамилия в русском языке склоняется как существительное женского рода (Мендзорйте, Мендзорйте, Мендзорйте).