Фамилия Мересиди — редкая для России, но хорошо узнаваемая в среде греческого происхождения. Её выдают суффикс и окончание: -иди — типичный греческий патронимический формант, означающий «сын» или «потомок». В русском языке такие фамилии часто не склоняются (как Куриди, Караманлиди), и Мересиди — из этого же ряда. Если разложить фамилию на составляющие, основа «Мерес» почти наверняка восходит к греческому имени или прозвищу.

Самая вероятная версия: в основе лежит греческое слово «μεράκι» (meráki) — «душа», «старание», «любовь к делу». В новогреческом языке это ёмкое понятие: человек, который делает что-то с душой, с особым усердием. Отсюда могло образоваться прозвище Мерекис или Мересис — «душевный», «старательный». Суффикс -иди добавил значение «потомок такого человека»: Мересиди — буквально «сын Мересиса».

Вторая, менее вероятная гипотеза связывает фамилию с топонимом. На карте Греции есть несколько небольших селений с корнем «Мерес», например, Мерес в регионе Эпир. Тогда Мересиди — «выходец из Мереса». Но для греческих фамилий на -иди прозвищная или лично-именная модель встречается чаще, чем топонимическая.

В Россию фамилия попала с волнами греческой миграции — в основном в XIX — начале XX века, когда греки переселялись в Причерноморье, на Кубань, в Крым, а позже и в центральные области. Носители Мересиди — это, скорее всего, потомки понтийских или малоазийских греков, сохранивших родовое имя. Сословная принадлежность могла быть разной: от торговцев и ремесленников до крестьян, но чётких данных об аристократическом происхождении нет.

В русском языке фамилия закрепилась в написании через «е», хотя в греческом оригинале могла звучать как Мерекиди или Мересис. Варианты с «к» и «с» — результат диалектных различий или записи на слух при оформлении документов. Сегодня Мересиди встречается нечасто, но её носители есть в Краснодарском крае, Ростовской области и Москве.