Фамилия Метаксуди — редкий случай в русском ономастиконе, который выдаёт в своём носителе потомка греческих переселенцев. Она образована не от славянской основы, а напрямую от греческого слова «μετάξι» (метакси) — «шёлк». Суффикс -уди (или -у́ди) в греческих фамилиях указывает на принадлежность к роду: буквально Метаксуди означает «из семьи шелкоторговца» или «шелковод». В греческом языке это типичный патронимический формант, аналогичный русскому -ов/-ев, но пришедший в Россию вместе с носителями фамилии.

В Россию эта фамилия попала, скорее всего, в XVIII–XIX веках, во время массовых миграций греков из Османской империи. Греки селились в Причерноморье (Одесса, Таганрог, Мариуполь), на Кубани, в Крыму и в крупных торговых городах. Предки современных Метаксуди могли быть купцами, ремесленниками, занимавшимися шёлком, или выходцами из греческих общин, где прозвище по роду занятий закрепилось как фамилия. Встречаются варианты написания: Метакса, Метакси, Метаксопуло, но форма на -уди — одна из самых характерных для понтийских греков.

С точки зрения словообразования, основа «Метакс-» прозрачна, а окончание -уди не имеет аналогов в русской системе фамилий. Поэтому при адаптации в документах фамилию не склоняли по русским правилам — она осталась неизменяемой. В дореволюционных метрических книгах можно встретить записи «грек Метаксуди» без указания сословия, что говорит о мещанском или купеческом происхождении большинства носителей. Дворянских корней у фамилии нет — греческие купцы редко получали дворянство, а если и получали, то меняли фамилию на более благозвучную для русского уха.

В современной России фамилия сохраняется в основном в Краснодарском крае, Ростовской области и в Москве — там, куда переезжали потомки греческих диаспор. Из-за редкости и специфического звучания её часто путают с грузинскими или турецкими фамилиями, но этимология однозначно указывает на греческий язык и ремесло, связанное с шёлком.