Фамилия «Мфрко» — редчайший случай в русской ономастике. Скорее всего, перед нами не славянская, а иноязычная фамилия, записанная кириллицей. В исконно русских фамилиях такое сочетание согласных («Мфр») практически не встречается — русский язык не любит стечения трёх согласных в начале корня, особенно с глухим «ф». Это сразу указывает на заимствование.

Наиболее вероятное происхождение — греческое. Фамилия может быть вариантом передачи греческой фамилии Μορφό (Морфо) или Μορφάκης (Морфакис), где корень «морф» связан с формой, видом, красотой (от греч. μορφή — «форма, облик»). В русской записи «Мфрко» могла возникнуть из-за редукции гласной: безударное «о» в первом слоге (Морфо) на слух воспринималось как нечто среднее, а при записи могло выпасть совсем, оставив «Мфр». Суффикс «-ко» типичен для украинских, белорусских и южнорусских фамилий (Хоменко, Шевченко), но здесь он мог «приклеиться» к греческой основе при адаптации на славянской почве, обозначая принадлежность или уменьшительность.

Другая, менее вероятная версия — искусственное происхождение. Фамилия могла быть образована в советское время от аббревиатуры или искажения сложной иноязычной фамилии при заполнении документов. Например, исходная фамилия вроде «Мофрако» или «Марфоко» могла упроститься до «Мфрко» из-за ошибки писаря или стремления к краткости.

Географически такую фамилию стоит искать в регионах с греческими диаспорами: юг Украины (Мариуполь, Одесская область), Крым, Приазовье, а также в среде греков-понтийцев, переселявшихся в Российскую империю. В центральных русских областях она практически не встречается.

Социальный контекст: если фамилия действительно греческая, предки могли быть торговцами, ремесленниками, моряками или священнослужителями. Греки в Российской империи часто занимались торговлей, судоходством и виноделием. Фамилия «Мфрко» — не крестьянская и не дворянская в классическом русском понимании, а скорее «этническая метка», сохранившая память о происхождении рода из Средиземноморья.