Фамилия Мигей — редкий пример фамилии, образованной не от полного крестильного имени, а от его уменьшительно-ласкательной формы. В основе лежит имя Михаил, которое в народной речи давало множество сокращений: Миша, Мишутка, Мигай, Мигун. Форма Мигей закрепилась в юго-западных говорах, где конечное -ей вместо -ай или -айло — характерная черта украинского и белорусского влияния на фамилию.

Словообразовательная модель проста: к основе Миг- добавлен суффикс -ей, который в восточнославянской антропонимии выполнял ту же роль, что и -ай (ср. Мигай, Молодей, Кислей). Такие суффиксы образовывали прозвища от глаголов или имён. В данном случае Мигей — это «маленький Михаил» или «Михаил, которого дома звали Мигей». Похожая логика в фамилиях Мигачёв, Мигунов, Мигаев.

Вторая версия, менее правдоподобная, выводит фамилию от глагола «мигать». Прозвище Мигей могли дать человеку с быстрым, бегающим взглядом или тому, кто часто моргал. Однако против этого говорит география: фамилия Мигей встречается почти исключительно в западных регионах России, на Украине и в Беларуси, где имя Михаил через местные говоры давало именно такую форму. Глагольное прозвище было бы более распространено в северных говорах, где суффикс -ей не типичен.

Фамилия не имеет дворянских корней и не фиксируется в старых родословных книгах. Скорее всего, предки Мигей — крестьяне или мещане, жившие на землях современной Черниговской, Гомельской или Брянской областей. В документах XVIII–XIX веков фамилия могла записываться как Мигей, Мигейко, Мигеенко — в зависимости от местной традиции оформления отчеств. Сегодня это редкая фамилия: по открытым данным, в России её носят не более нескольких сотен человек, и почти все они сосредоточены в Брянской области и приграничных районах Беларуси.