Фамилия Мигеев — один из тех случаев, когда написание расходится с произношением, а происхождение упирается в редкое имя. На слух она почти сливается с более распространённой фамилией Минеев, но корень у неё другой.

В основе фамилии лежит крестильное имя Мигей. Это народная, обиходная форма церковного имени Емельян (в крещении — Емилиан). Уменьшительные варианты вроде Мигей, Мига, Мигун образовывались по той же модели, что и более известные Тимоха от Тимофей или Михей от Михаил. Имя Емельян в русской среде дало целый куст фамилий: Емельянов, Емелин, Милюков, а Мигеев — один из боковых, менее очевидных отростков.

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: суффикс -ев присоединялся к основе, оканчивающейся на -й. Мигей → Мигеев, то есть «сын Мигея». Если бы в основе было имя Мигей с ударением на второй слог, фамилия писалась бы через «ё» — Мигёв, но в русской традиции закрепилось написание через «е», и ударение в ней чаще всего падает на второй слог: Миге́ев.

Встречается фамилия в основном в центральных и южных областях России. По данным переписей, она не массовая: носителей насчитывается несколько тысяч, и основная их часть живёт в Воронежской, Ростовской областях и в Краснодарском крае. Встречаются также варианты написания Мигеев — с одним «е» (Мигеев) и изредка Мигейев, но словарь русских фамилий фиксирует именно форму Мигеев как литературную.

Интересно, что фамилия Мигеев не связана с испанским именем Мигель, хотя по звучанию это напрашивается. В русской ономастике это чисто славянский патроним от православного имени, и никакого «западного следа» в ней нет.