Фамилия Михелкина образована от имени Михелка — уменьшительной формы крестильного имени Михаил. В русской ономастике это имя прошло долгий путь: от церковного Михаил через бытовые варианты Михей, Михейко, Михалка до ласкательной формы Михелка. Суффикс -к- в данном случае указывает на уменьшительность или принадлежность, характерную для русских прозвищ и неофициальных имён. Фамилия относится к типично русской модели на -ин, которая образуется от основ на -а/-я: Михелка → Михелкин → Михелкина.

Интересно, что основа Михелка встречается в основном в западных и южных регионах России, а также на Украине и в Белоруссии, где аканье и мягкое произношение давали формы вроде Михелка вместо более привычного Михалка. Это говорит о том, что предки носительницы фамилии могли жить в зоне смешения говоров — возможно, в Смоленской, Брянской или Псковской губерниях. В документах XVII–XVIII веков фамилии на -ин фиксировались сначала как отчества: «Иван Михелкин сын» — то есть сын Михелки.

По сравнению с однокоренными фамилиями — Михайлов, Михеев, Михалкин — Михелкина стоит особняком: она реже встречается и сохранила более архаичную форму имени. В дореволюционных списках фамилию могли записывать через «е» или «ё»: Михёлкина, но написание через «е» закрепилось как нормативное. Сословной принадлежности у этой фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и мещане, и духовенство — имя Михаил было одним из самых распространённых на Руси.

Таким образом, Михелкина — фамилия, прямо отсылающая к имени предка по мужской линии, который в быту звался Михелкой. Она не несёт в себе ни ремесленного, ни географического значения, а лишь указывает на родство: «дочь (или жена) Михелки». В современной России фамилия редкая, но встречается в центральных и южных областях, что подтверждает её исконно русское происхождение.