Фамилия Михунова вписывается в обширную группу русских фамилий, образованных от производных форм крестильного имени Михаил. В основе лежит просторечная форма Михун — один из вариантов, наряду с Михей, Михан, Михал. Имя Михаил (в переводе с древнееврейского «кто как Бог») было одним из самых распространённых на Руси, поэтому число его уменьшительных и обиходных вариантов огромно. Суффикс -ун- в данном случае нередко придавал имени оттенок фамильярности или указывал на человека с определённой чертой характера (сравните говорун, молчун), но в именах он часто просто служил для образования бытовой формы.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, указывающим на принадлежность. Михунова — это женская форма, мужская — Михунов. Первоначально это было отчество: «чей сын?» — Михунов, то есть сын Михуна. Такая словообразовательная схема типична для центральных и северных регионов России, где фамилии на -ов и -ин закрепились в XVI–XVII веках.

Стоит отметить, что корень «мих-» мог пересекаться и с другими основами, но в случае с фамилией Михунова наиболее вероятна именно связь с именем Михаил. Альтернативные версии, выводящие фамилию от названия ремесла или географического объекта, выглядят надуманными: прозвище Михун в старину фиксируется в документах именно как производное от канонического имени. Например, в актах XVII века встречаются крестьяне и посадские люди с таким именованием.

В социальном плане фамилия Михунова не указывает на принадлежность к дворянству или духовенству. Скорее всего, её носили крестьяне, мещане или служилые люди «по прибору» — те слои, где отчество на -ов постепенно превращалось в наследственную фамилию. Географически фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда, но чаще фиксируется в областях бывшего Владимирского и Костромского княжеств, где имя Михаил в народных формах было особенно популярно.

Таким образом, если вы носите фамилию Михунова, ваши предки по мужской линии с большой долей вероятности звались Михунами — и это было не прозвище, а обиходный вариант имени, данного при крещении в честь архангела Михаила.