Фамилия Микицюра звучит по-южнорусски или по-белорусски, и почти наверняка связана с личным именем или прозвищем, а не с родом занятий. В её основе лежит глагол, который в разных славянских говорах дал прямо противоположные значения. По одной версии, прозвище Микицюра восходит к белорусскому «мікіціць» — «сутяжничать, хитрить, плутовать». Скорее всего, такое прозвище носило иронический оттенок: так могли поддеть человека, который любит мудрить или сутяжничать по мелочам, подчёркивая его дурные привычки.

Однако есть и другая, не менее правдоподобная версия, которая опирается на украинский глагол «микитити» — «рассуждать, кумекать». В таком случае прозвище меняет знак с минуса на плюс: Микицюрой могли назвать мужика здравомыслящего, толкового, который умеет дойти до сути своим умом. Обе трактовки имеют право на жизнь, и выбор между ними зависит от того, в какой местности и в какой семье закрепилось прозвище. В русском языке эти глаголы не прижились, поэтому фамилия чётко указывает на западнорусское или украинское происхождение рода.

Третья гипотеза связывает фамилию напрямую с крестильным именем Никита. В белорусском и украинском просторечии имя Никита часто звучало как Микита, отсюда и уменьшительно-пренебрежительная форма Микицюра. Греческое имя Никита переводится как «победитель», и если фамилия действительно произошла от него, то предок носителя был просто Микитой, а его потомков или домочадцев стали звать Микицюрами. Эта версия выглядит даже более естественной, чем прозвищная: суффикс -юр- характерен для западноукраинских и белорусских фамилий, образованных от личных имён.

Сама фамилия образована по модели, типичной для западных регионов: к основе Микиц- добавили суффикс -юр-, который придаёт слову оттенок уменьшительности или принадлежности. Такая модель встречается у фамилий вроде Микитюк или Микитюра, но Микицюра стоит особняком из-за шипящего «ц», который смягчает звучание. В итоге мы имеем фамилию, которая могла возникнуть независимо в разных семьях по разным причинам: как насмешливое прозвище хитреца, как уважительное именование умника или как производное от церковного имени. Точно сказать, какая из версий верна для конкретного рода, уже невозможно, но все они ведут к одному корню — живому народному слову, которое когда-то точно характеризовало человека.