Фамилия Милищенко — характерный пример украинской модели фамилии на -енко, которая в XVII–XVIII веках была распространена в Поднепровье, на Слобожанщине и в Запорожье. Суффикс -енко в этой традиции означал «сын» или «потомок», то есть Милищенко — буквально «сын Милища». Основа здесь — имя или прозвище Милищ, которое, скорее всего, восходит к крестильному имени Милий (от латинского «милый, приятный»). В украинской народной среде имя Милий могло приобрести уменьшительно-пренебрежительную форму Милищ, от которой и пошла фамилия.

Реже встречается версия, что в основе лежит прозвище Милица — от слова «милый» или «милость», но тогда ожидалась бы форма Милиценко. Словообразовательная модель Милищенко (с суффиксом -ищ-) указывает на то, что родоначальника звали именно Милищ, а не Милица. Такой патроним типичен для украинских фамилий, где -ищ- выступает как увеличительный или пренебрежительный суффикс, но в имени собственном он просто фиксирует конкретную форму.

Географически фамилия Милищенко чаще всего встречается в центральных и восточных областях Украины — Полтавской, Черкасской, Киевской, а также в соседних регионах России, куда переселялись украинские крестьяне и казаки. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках носители фамилии записаны преимущественно как мещане или казаки, реже — крестьяне. Дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано, что говорит о её народном, а не аристократическом происхождении.

В русском контексте фамилию могли адаптировать: в документах XIX века встречается написание Милищенков — с добавлением русского суффикса -ов, что делало её более привычной для великорусского уха. Однако исходная форма Милищенко сохранилась и сегодня остаётся основной. Если вы носите эту фамилию, ваш предок по мужской линии, скорее всего, был украинцем, которого звали Милищ, а сам он принадлежал к казачьему или крестьянскому сословию.