Фамилия Милоновы — отчество второго уровня: её основа — личное имя Милон, а суффикс -ов указывает на принадлежность потомку этого человека. Разбираем по частям: Милон + -ов = «сын Милона», внук или более дальний потомок. Модель типична для русских фамилий, но само имя в основе встречается нечасто, что и делает фамилию заметной.

С происхождением имени Милон есть две основные версии, и обе правдоподобны. Первая ведёт к греческому «милон» — «яблоневый, яблочный», либо к названию области Милия в Малой Азии. В древности это имя прославили двое: кротонский атлет Милон, шестикратный олимпийский победитель, который, по легенде, носил по арене взрослого быка, и римский трибун Тит Анний Милон, враг Клодия, чья гибель в уличной стычке запустила цепочку событий, приведших к гражданской войне в Риме. Вторая версия — славянская: от слова «милый», то есть «любимый, дорогой». Так могли назвать долгожданного ребёнка. Какая версия ближе к русской почве? Скорее славянская: имена с корнем мил- (Милан, Милена, Милован) на Руси были естественны и не требовали античных ассоциаций. Греческое имя через церковные святцы тоже могло прийти, но для крестьянской среды проще было воспринять Милона как «милого».

Первые письменные следы имени уходят в начало XVII века. В «Ономастиконе» С.Б. Веселовского упомянут Милон Алексеевич, 1613 год, Алатырь. Это важная зацепка: Алатырь — город-крепость на Суре, в то время активно заселявшийся служилыми людьми. Значит, уже в первой половине XVII века имя бытовало в Поволжье, и от этого конкретного человека или его тёзок вполне могли пойти Милоновы.

Точное место и время возникновения фамилии назвать сложно: фамилии у крестьян и посадских закреплялись медленно, на протяжении XVII–XIX веков. Но сам факт, что имя Милон встречается в документах Смутного времени, говорит о живом употреблении, а не о книжной экзотике. Носитель фамилии Милонов мог быть потомком крестьянина, ремесленника или служилого человека — сословие по одной только фамилии не определить.

Стоит заметить, что фамилия редкая: в отличие от массовых Ивановых или Петровых, Милоновы не разрослись в огромный род. Это делает её более локальной — вероятно, корни семьи стоит искать в тех же местах, где имя фиксировалось в XVII веке, то есть в среднем Поволжье.

Итог простой: Милоновы — наследники человека по имени Милон, и если верна славянская версия, то предок был «милым», любимым в своей семье. Фамилия — памятник не столько славянской письменности, сколько живому народному именнику, где рядом уживались и древние греческие имена, и исконно русские ласковые прозвища.