Фамилия Миннеханова — женская форма фамилии Миннеханов, и её происхождение напрямую связано с тюркским, скорее всего татарским или башкирским, именем Миннехан. В основе лежит арабское слово «мин» (в значении «тысяча»), которое в тюркских языках стало частью сложных имён, символизируя «тысячу достоинств» или «богатство». Вторая часть — «хан» (владыка, правитель). Имя Миннехан буквально означало «тысяча ханов» или «богатый, как хан», но чаще всего его давали как пожелание ребёнку стать благородным и уважаемым человеком.

Словообразовательная модель здесь прозрачна. К основе имени Миннехан добавился русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова). Такая адаптация характерна для многих нерусских фамилий Поволжья и Приуралья: в XIX—XX веках, когда татары и башкиры массово получали фамилии по отцу, русская администрация часто оформляла их именно так — через суффикс принадлежности. Поэтому Миннеханов — это буквально «сын Миннехана», а Миннеханова — «дочь/жена Миннехана».

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на -ов, которые образованы от крестильных имён, эта фамилия сохранила мусульманский антропонимический пласт. Встречается она в основном в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в Средней Азии. Встречаются варианты написания Миннеханов/Минниханова, но первая форма — основная, так как она точнее передаёт звучание исходного имени.

Сословного барьера у фамилии не было: носителями могли быть и крестьяне, и купцы, и муллы. В метрических книгах и переписях XIX века такие фамилии фиксировались у татарских и башкирских родов, чьи предки не были служилыми или дворянами, но имели уважаемое в общине имя. Сегодня фамилия не редкая, но и не массовая — её можно считать маркером регионального происхождения, а не социального статуса.