Фамилия Мирзалис — одна из тех, что сразу выдают нерусское происхождение. Она не вписывается в типичные славянские модели на -ов, -ин или -ский. Её основа и суффикс указывают на восточные и греческие корни, а сама фамилия — относительно редкая, что делает её разбор более гипотетическим, чем для массовых фамилий.

Первая часть, «Мирза», восходит к персидскому титулу «мирза» (от «амир-заде» — «сын эмира» или «княжич»). В тюркских языках это слово означало «писарь», «секретарь» или просто «господин», «образованный человек». В Российской империи «мирза» было распространённым компонентом фамилий среди татарской, башкирской и кавказской знати. Вторая часть, «-лис», — это греческий суффикс принадлежности (-λής), который в тюркских языках мог звучать как -ли/-лы, указывающий на место или происхождение. Однако в данном случае «-лис» — это скорее греческое окончание, характерное для фамилий греков Причерноморья и Малой Азии. Сочетание «Мирза» + греческий суффикс — явный признак контакта культур.

Вероятнее всего, фамилия Мирзалис сложилась в среде греков-понтийцев или греков, живших в Крыму и на юге России. Там тюркские имена и титулы легко встраивались в греческую фамильную модель. Носитель такой фамилии мог быть потомком человека, которого звали Мирза (по титулу или прозвищу), а суффикс «-лис» означал «из рода Мирзы» или «принадлежащий Мирзе». Встречается также вариант фамилии Мирзалиев — это уже адаптация для тюркских языков (азербайджанского, турецкого). Мирзалис же — более старая, «греческая» форма.

Географически фамилия сегодня встречается в Греции, на Кипре, а также среди греческой диаспоры в постсоветских странах. В России она крайне редка, что подтверждает её узкую этническую привязку. Сословно предки Мирзалисов, скорее всего, не были крестьянами: носитель титула «мирза» в тюркской среде принадлежал к служилому или знатному слою. Но в греческой среде это могло быть просто прозвище, данное торговцу или переводчику, который часто общался с турками.

Однозначной этимологии нет, но наиболее правдоподобная версия — греческая фамилия, образованная от тюркского титула «мирза» с местным суффиксом. Это редкий случай, когда фамилия не переводится, а именно рассказывает о культурном смешении: человек мог быть греком по языку и вере, но носить имя, данное по уважительному обращению в Османской империи.