Фамилия Мишекурина — редкий случай, когда в основе лежит не имя, а прозвище, образованное от глагольной формы. Разбираем её по частям: корень «миш» (от «мишень», но не в прямом значении), суффикс «-ек-» (уменьшительный или пренебрежительный) и окончание «-урин» (притяжательный суффикс, указывающий на принадлежность). Получается, что Мишекура — это человек, которого прозвали «мишенью» или, скорее, «целью для насмешек». В русских говорах слово «мишень» могло означать не только цель для стрельбы, но и «предмет для зубоскальства», «посмешище». Суффикс «-ек» здесь добавляет оттенок пренебрежения: не просто «мишень», а «мишенька» — тот, над кем постоянно подшучивают.

Фамилия оканчивается на «-урин», что типично для северных и центральных областей России (Вологодчина, Архангельская губерния, Костромская земля). Такая модель образования — от прозвища с суффиксом «-ура» (ср. Мишекура → Мишекурин) — встречается нечасто. Она родственна фамилиям вроде Кочкурин (от «кочка» — неровность) или Шишурин (от «шиш» — бес, чертёнок). Все они указывают на внешнюю или поведенческую особенность, которую заметили окружающие.

Есть и вторая, менее вероятная версия: основа могла произойти от тюркского имени Мишек (уменьшительное от Миша — медведь) с добавлением русского суффикса. Но тогда форма была бы Мишеков или Мишекин, а не Мишекурин. Тюркский след в этой фамилии слабый, и лингвисты склоняются к чисто русскому происхождению от прозвища.

Носитель фамилии Мишекурин — скорее всего, потомок человека, который жил в деревне на севере или северо-востоке России и получил прозвище за свой неловкий или смешной вид. В сословном плане это крестьянская или мещанская фамилия: дворяне с таким окончанием почти не встречаются. В современных справочниках фамилия редкая; по данным переписей, её можно найти в Вологодской области и в Пермском крае — там, где сохранились старые говоры.