Фамилия Мишинцева — женская форма фамилии Мишинцев, и её редкость сразу бросается в глаза. В отличие от массовых фамилий на -ов или -ин, здесь работает суффикс -цев, который встречается в русских фамилиях заметно реже и обычно указывает на более позднее или локальное происхождение. Если разобрать словообразовательную цепочку, то основа — Мишин, а суффикс -цев добавляет значение принадлежности: Мишинцев буквально означает «потомок Мишина» или «человек из семьи Мишиных». Это так называемая фамилия второго порядка, когда отчество или прозвище отца (Миша или Мишин) стало основой для фамилии следующего поколения.

Корень здесь, очевидно, восходит к имени Михаил в его уменьшительно-бытовой форме Миша. В русской ономастике это один из самых распространённых источников, но именно вариант с суффиксом -цев встречается нечасто. Для сравнения: фамилии Мишин, Мишков, Мишаков куда более типичны, а Мишинцев — скорее исключение, которое могло закрепиться в определённой местности, например, на севере или в центральных губерниях, где бытовала модель «от отчества к фамилии через -цев». Такая форма указывает на то, что предка звали Миша, но не просто «сын Миши» (как у Мишина), а «внук или потомок Мишина», что подчёркивает династический оттенок.

Есть и другая версия, менее вероятная, но допустимая: прозвище Мишинец. В говорах так могли называть человека, связанного с медведем (мишка — народное название зверя), либо переселенца из села с названием Мишино или Мишинцы. В таком случае фамилия Мишинцев могла означать «потомок Мишинца», то есть выходца из определённого места. Однако первая версия — от имени — выглядит проще и правдоподобнее, так как географические прозвища с таким суффиксом обычно давали целым группам, а не отдельным семьям.

Социальный контекст фамилии Мишинцев тоже нестандартен. В XIX веке фамилии на -цев часто принадлежали крестьянам или мещанам, а не дворянам, и закреплялись в документах позже, иногда уже после отмены крепостного права. Поэтому Мишинцева — фамилия, которая могла появиться в метрических книгах или ревизских сказках в середине XIX века, когда крестьянские семьи получали окончательные фамилии по отцам или дедам. Носительница этой фамилии может с высокой вероятностью проследить свои корни до человека по имени Михаил, которого в быту звали Миша, а его сыновей или внуков уже записали как Мишинцевы.