Фамилия Мискачев — редкая, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. Суффикс -ев указывает на типичную русскую патронимическую модель: так образовывали фамилии от имени или прозвища отца, оканчивающегося на мягкий согласный или -й. Основа здесь — Мискач. Вопрос в том, что это за слово.

Самая вероятная версия: Мискач — форма крестильного имени Миска (уменьшительное от Михаил, через народные варианты Мисаил или Миска). Суффикс -ач в русских прозвищах часто придавал оттенок принадлежности или характерного признака (ср. трубач, рвач). Таким образом, Мискач — «сын Миски» или «человек, относящийся к Миске». Фамилия образована по схеме: Мискач → Мискачев.

Менее распространённая, но возможная версия связывает основу с диалектным словом миска — так в некоторых говорах называли не только посуду, но и невысокого, круглолицего человека (сравните с прозвищем Миска у С. Б. Веселовского в «Ономастиконе»). В этом случае Мискач — человек, получивший прозвище по внешности или роду занятий (например, гончар, делавший миски).

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям и Поволжью — там чаще встречаются окончания на -ачев вместо более северного -аков. В дореволюционных переписях Мискачевы фиксировались в основном среди крестьян и мещан.

Отсутствие в фамилии приставки или дворянского суффикса (-ский) недвусмысленно говорит о её простонародном происхождении: предок носителя был, скорее всего, крестьянином или посадским человеком, которого в документах записали по отцу — Мискачу.